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CodonCode Aligner | DNA测序软件

DNA 序列组装和比对程序

本程序专为 DNA 序列组装、重叠群编辑、突变检测 等任务设计，具备以下特点：

  • 兼容 Phred-Phrap，可无缝集成至现有分析流程。

  • 完全支持序列质量评分，提高分析的准确性和可靠性。

  • 无需复杂的命令行操作 或 Perl 编程基础，即可高效执行碱基调用和序列组装。

  • 采用最新算法，提升比对速度和精准度。

  • 直观的用户界面，便于快速上手，提高工作效率。


软件型号

软件名称 交易方式 交货时间 价格
CodonCode Aligner - 学术/政府：单用户许可证 电子配送 请联系我们 请联系我们
CodonCode Aligner - 学术 / 政府 ： 并发许可证 电子配送 请联系我们 请联系我们
CodonCode Aligner - 商业版 ： 单用户许可证 电子配送 请联系我们 请联系我们
CodonCode Aligner - 业务 ： 并发许可证 电子配送 请联系我们 请联系我们

软件说明

CodonCode Aligner 功能介绍：

CodonCode Aligner 是一款功能强大的 DNA 序列分析软件，支持 从测序数据导入、序列组装、比对、突变检测到高级分析。

核心功能

✅ 数据导入

  • 从文本文件导入序列

  • 支持 ABI、SCF 和 FASTQ 文件格式

✅ 序列处理

  • 末端剪切（End clip）

  • 载体序列修剪（Vector trim）

  • 组装 contigs（重叠群）

  • 比对至参考序列

  • 组装时保持与跟踪数据的关联

✅ 高级分析

  • 依据样本名称分组组装或比对

  • 识别 杂合突变（Heterozygous mutations）

  • 插入/缺失（indel）分析

  • 定义并快速导航 感兴趣区域（Features）（例如低质量共识区域）

  • 生成 系统发育树（Phylogenetic trees） 和 限制性内切酶图谱

✅ 自动化和可视化

  • 直接在 Aligner 项目中运行 Phred 和 Phrap

  • 导出序列及特征信息

  • 显示差异表（Difference tables）及蛋白翻译结果

  • 引物设计（Primer design）

  • 细菌基因组组装 及小规模 NGS（下一代测序） 项目处理

  • 进行 RFLP 分析（酶切位点筛选）并创建 虚拟凝胶图

  • 甲基化序列分析 & 原始跟踪数据查看

CodonCode Aligner 许可证类型

CodonCode Aligner 提供多种许可证类型，具体适用于不同用户群体。

📌 许可证类别

🔹 学术/政府许可证（Academic/Government License）
适用于 大学、非营利组织及政府资助研究机构。
✅ 支持 Phred 和 Phrap（可用于碱基调用和序列组装）。

🔹 商业许可证（Commercial License）
适用于 营利性公司用户。
🚫 不包括 Phred 和 Phrap 组件（需要单独获取）。

📌 许可证形式

✔ 单用户许可证（Single-User License）

  • 许可证绑定至特定用户。

✔ 并发许可证（Concurrent License / Network License）

  • 通过 Aligner License Server 管理多个设备的使用权限。

  • 可在 任意数量的计算机 上安装，使用数量受购买的许可证数量限制。

📌 许可证有效期

  • 所有许可证均为永久许可证，包含 1 年的免费更新和技术支持。

  • 学生许可证（Student License）：适用于 本科生、研究生和博士后，有效期 2 年。

📩 如需申请或咨询，请联系我们。


软件资料